Seppo Heikinheimo teki itsemurhan toukokuussa 1997 helsinkiläisessä hotellissa.
Postuumisti ilmestyneessä omaelämäkerrassaan Mätämunan muistelmat hän kertoi sille syitä. Hän myös paljasti tehneensä päätöksen itsemurhastaan maaliskuussa, kun hän tappoi itsensä toukokuussa.
Syitä itsemurhaan oli esimerkiksi pesäpallo-otteluissa soitettava ”mökämusiikki”, jonka vuoksi Heikinheimo ei enää voinut otteluissa vierailla.
Yksi syistä oli Heikinheimon surkimukseksi kutsumansa Martti Ahtisaaren valinta presidentiksi sekä Helsingin Sanomien kulttuuritoimituksen ilmapiiri, joka oli muuttunut epämiellyttäväksi.
Elämäkertakirjassaan hän myös totesi, ettei niitä (kirjoja) kannata kirjoittaa, koska ei niitä kukaan lue.